2. Tup FC. จาก WE League อันดับ 4 พบ Friendship จาก FS League อันดับ 4
ผู้ชนะคู่ที่ 1และ2 จะผ่านเข้ารอบแบ่งกลุ่ม อยู่ Group 1
3. Lalanta FC. จาก WE League อันดับ 5 พบ Oon Star A จาก FS League อันดับ 5
ผู้ชนะคู่ที่ 3 จะผ่านเข้ารอบแบ่งกลุ่ม อยู่ Group 2
เนื่องจากการแข่งขันในปีนี้ ต้องมีการปรับเปลี่ยนจำนวนทีมที่เข้าร่วมและรูปแบบการแข่งขัน เพื่อให้เหมาะสมสอดคล้องกับ
การแข่งขัน ซึ่งก็ยังมุ่งเน้นสร้างความสัมพันธ์ในการแข่งขันระหว่างลีกใน กทม. เช่นเคย แม้จะมีการเปลี่ยนแปลงไปตามวัฏจักร
เกิด แก่ เจ็บ ตาย ผู้ดำเนินการจัดการแข่งขันทุกฝ่ายก็ยังมีอุดมการณ์ที่จะสานต่อกิจกรรมตรงนี้ให้มีการแข่งขันทุกๆ ปี แม้จะต้องมีการปรับเปลี่ยนไปตามสถานการณ์ปัจจุบัน ซึ่งในปีนี้ F League ได้ยุบตัวไปไม่มีการจัดการแข่งขัน ทำให้ CFN Champions League 2008 ในปีนี้ต้องมีการปรับโควตาทีมที่เข้าร่วม ซึ่งจากเดิมให้โควตากับทุกๆ ลีกแตกต่างตามความพร้อมของลีกนั้น ๆ
จากเดิม WE League และ FS League ได้โควตา 4 ทีม เข้าร่วมแข่งขันและจากที่ F League ไม่มีแล้ว ทำให้นำโควตาของ F League กลายมาเป็นได้โควตาเพิ่มให้ WE และ FS อีก ลีกละ 1 ทีม เป็น ทั้งหมด 5 ทีม
